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院长：匡光力 全面负责研究院工作。 分管发展规划、财务资产、国家安全、科学传播、国际合作； 分管综合处、财资处； 联系强磁场中心、核安全所。
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党委书记：王英俭 主持研究院党委工作。 分管干部人事、继续教育、创新文化、群团工作； 分管人教处、党建与监督处。 |
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副院长：吴四发 分管基建、信息化、文献情报档案、后勤服务、安全保卫； 分管服务中心、信息中心、学校、基建办。 |
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副院长：刘建国 分管技术科学研究、保密体系、质量体系（兼任管代）、技术安全； 分管高技术处、保密办、质量办； 联系安光所、智能所、先进制造所。 |
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副院长：江海河 分管院地合作和院校合作、知识产权转移转化、产业创新平台建设、物质科学中心日常事务； 分管科技发展处； 联系医学物理中心、合肥创新院、安徽工研院（应用技术研究所）、研究院投资企业。 |
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副院长：万宝年 分管基础科学研究、研究生教育； 分管科研规划处、研究生处； 联系等离子体所、固体所、技术生物所。 |
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邹士平 主持研究院纪委工作。 分管离退休、医疗，协管党务；分管监审室、离退办、医保办。 |
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副院长（兼）：朱长飞 协管综合科学中心建设、院校合作工作。 |
