2009年11月27日，中国科学技术信息研究所发布了“2008年度中国科技论文统计结果”。结果表明，合肥研究院2008年度发表的科技论文再获丰收。SCI论文篇数、SCI被引篇数和被引次数、EI和ISTP论文篇数、在国内科研机构总排名等较往年有了较大幅度的提升，这些成绩的取得客观地反映了实施知识创新工程以来，合肥研究院科技创新能力的持续增强。

　　根据统计结果，2008年度合肥研究院发表的SCI收录论文，在全国科研机构的排名第7位，比上一年度上升1位；发表的EI收录论文，排名第5位，比上一年度上升2位；ISTP收录论文排名仍保持在前10位。2008年度合肥研究院国际论文被引用篇数/次数，由2007年度的487/1445，上升到564/1666，在全国科研机构排名第11位。合肥研究院国际论文累计（1999—2008）被引用篇数/次数上升到1782/17832，排名第9位；在累计被引超过400次的国际论文中，合肥研究院固体所有一篇物理学论文入选，李勇、孟国文、张立德所著的发表在Appl. Phys.Lett【2000,76(15):2011—2013】刊物上的论文，被引568次，列全国第一作者排名第四。

　　在2008年中国百篇最具影响国际学术论文中，合肥研究院固体所有1篇入选，论文为曾海波、蔡伟平等人的ZnO-based hollow nanoparticles by seletive etching:Elimination reconstruction of metal-semiconductor interface,improvement of blue emission and photocatalysis，【ACS NANO,2008，2（8）：1661-1670】。在2008年百篇最具影响国内学术论文中，合肥研究院等离子体所有1篇入选，论文为吴宜灿的论文“聚变发电反应堆概念设计研究”，【核科学与工程，2005，25（01）：76页】。