2009年9月7日至10日，中国新时代认证中心审核组对研究院院质量管理体系进行了军品第二次监督、民品再认证及民品换版审核。审核组认为：最高管理者重视质量管理体系的完善和保持；研究院的研制过程和管理过程识别清楚，研究流程明确；院质量管理体系基本形成了自我完善和自我改进的机制，有一定的自我完善能力，审核证实质量管理体系基本符合新版GB/T 19001-2008标准要求，运行正常、有效，待对本次审核开出的不符合项采取措施进行整改，经书面验证后同意推荐注册资格/换发证书。研究院领导对审核组的辛勤工作表示了感谢，并表示要针对不符合项认真讨论整改，举一反三对体系覆盖范围内所有相关部门或项目进行检查，避免类似问题的再发生。