院长：匡光力

全面负责研究院工作。

分管发展规划、财务资产、国家安全、科学传播、国际合作；

分管综合处、财资处；

联系强磁场中心、核安全所。

党委书记：王英俭

主持研究院党委工作。

分管干部人事、继续教育、创新文化、群团工作；

分管人教处、党建与监督处。

副院长：吴四发

分管基建、信息化、文献情报档案、后勤服务、安全保卫；

分管服务中心、信息中心、学校、基建办。

副院长：刘建国 

分管技术科学研究、保密体系、质量体系（兼任管代）、技术安全； 

分管高技术处、保密办、质量办； 

联系安光所、智能所、先进制造所。 

副院长：江海河

分管院地合作和院校合作、知识产权转移转化、产业创新平台建设、物质科学中心日常事务；

分管科技发展处；

联系医学物理中心、合肥创新院、安徽工研院（应用技术研究所）、研究院投资企业。

副院长：万宝年

分管基础科学研究、研究生教育；

分管科研规划处、研究生处；

联系等离子体所、固体所、技术生物所。

邹士平 

主持研究院纪委工作。

分管离退休、医疗，协管党务；分管监审室、离退办、医保办。 

副院长（兼）：朱长飞 

协管综合科学中心建设、院校合作工作。