近日，美国西奈山伊坎医学院终身副教授 Alexander M. Tsankov博士做客健康所“医路研谈”大讲堂，作题为"Improving Stratification of Lung Cancer Ontogeny and Treatment Using Single-Cell Genomics"的学术报告。健康所40余名科研、临床骨干及研究生到场参会。

报告中，Tsankov博士重点介绍了团队利用单细胞多组学深化胸部恶性肿瘤精准分层的两项工作。团队构建了首个恶性胸膜间皮瘤单细胞全景图谱，鉴定出与不良预后显著相关的肿瘤内在表达程序，揭示了NKG2A:HLA-E 相互作用对上皮样间皮瘤具有重要治疗潜力；在肺腺癌研究中，团队针对长期缺乏靶向分层策略的TP53突变患者，阐明其重塑多细胞生态、诱导免疫抑制的作用机制，并提示该类患者接受抗PD-1治疗后生存期更优，为基于TP53状态开展免疫治疗精准分层提供了有力证据。

随后，Tsankov 博士介绍了团队在肿瘤细胞起源判定上的前沿方法学成果。团队创新性地利用单细胞染色质可及性测序（scATAC-seq）与全基因组体细胞突变分布之间的负相关关系，构建了基于机器学习的细胞起源预测框架。该模型准确推断了肺腺癌、肺鳞癌、小细胞肺癌及胸膜间皮瘤等多种肿瘤的起源细胞类型，为深入理解胸部恶性肿瘤的早期发生与分层演化提供了新视角。

互动环节，与会师生就单组学与多组学的选择与整合、细胞起源预测方法在肿瘤进化背景下的适用性等问题与 Tsankov 博士交流。他以“盲人摸象”作比，指出多组学整合才能呈现“完整的大象”。

Alexander M. Tsankov 博士现任美国西奈山伊坎医学院终身副教授。他博士毕业于麻省理工学院计算机科学专业，随后在哈佛大学及Broad Institute从事博士后研究，研究方向为表观基因组学与再生生物学，长期致力于运用单细胞转录组学、表观基因组学、空间基因组学及机器学习方法，解析肿瘤的细胞组成与调控结构。其实验室在肺癌生物学与肿瘤基因组学领域取得多项重要成果，相关论文发表于Nature、Cell等国际知名期刊。

报告会现场